دکتر ولایتی در کتاب دایرهًْالمعارف پزشکی اسلام و ایران با همکاری گروهی از فرهیختگان و دانشمندان میکوشد با نگاهی علمی و بیطرفانه واقعیتهای صحیح و بیشائبۀ دانش پزشکی اسلامی را در قالب دایرهًْالمعارفی و با نظم الفبایی تبیین نماید. مدخلهای این دانشنامه در 9 گروه دستهبندی شده است: اعلام و اشخاص؛ کتابها و تألیفات، گیاهان دارویی، بیماریها، مفاهیم و اصطلاحات؛ مراکز و سازمانها؛ داروها؛ اندامها؛ ابزار کار پزشکان.